No ano de 2003, a estrutura do Núcleo foi montada, como parte da Pró-Reitoria de Pós-Graduação e Pesquisa - PROPEP, tendo a primeira chamada de projetos lançada, de forma conjunta com a Incubal, em 2004, prospectando vários projetos na área de tecnologias sociais e avançadas. O primeiro processo de pré-incubação do Núcleo deu-se com três empreendimentos. Destes, a Organização de Mulheres Maria Mariá foi a primeira empresa a ser graduada pelo Núcleo Espaço Gente em maio de 2007.

Desde então, o Núcleo segue em atividades conjuntas com a Incubal no apoio a novos empreendimentos.